结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.85(10.16~10.22)
上周发布了哪些“结构”文章?又取得了哪些科研进展?
结构速递栏目以每周“结构”相关领域刊文为主题,梳理一周结构发文大事记,“结构速递”为您传递最新、最快、最权威的结构资讯。
2023.10.16~2023.10.22
CNS刊登文章
01
Cell
2023/10/17
1.“Molecular basis of Wnt biogenesis, secretion, and Wnt7-specific signaling”
Wnt蛋白在ER中被Porcupine (PORCN)酶脂化,并与Wntless (WLS)结合进行细胞内运输和分泌。这些低溶解度Wnts从ER转移到细胞外基质的机制仍不清楚。
Wnt7a是一种参与中枢神经系统血管生成和血脑屏障维持的重要Wnt蛋白,通过对Wnt7a结构和功能的分析,来自美国德克萨斯大学西南医学中心的李晓淳和齐晓峰阐明了Wnt生成和Wnt7特异性信号转导的原理。Wnt7a- Wntless(WLS)复合物与calreticulin(CALR)结合,表明CALR在Wnt生物发生过程中作为伴侣蛋白促进Wnt从Porcupine(PORCN)转移到WLS。结构、功能分析和分子动力学模拟证明,Wnt与WLS核心中的磷脂结合调节Wnt和WLS之间的结合和解离,揭示了一种脂质介导Wnt分泌的机制。最后,Wnt7a与细胞表面Wnt7共受体RECK结合的结构,揭示了RECKCC4与Wnt7a的N端结构域结合以激活Wnt7特异性信号传导的机制。此项工作通过结构生物学,生物化学和细胞生物学的方法鉴定了第一个Wnt合成中的伴侣蛋白,提出了Wnt合成和分泌的新模型,并且阐释了Wnt7共受体的作用。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01075-9
2023/10/17
2.“Molecular basis of anaphylatoxin binding, activation, and signaling bias at complement receptors”
补体系统是人先天性免疫反应的重要组成部分,而这一级联的最终产物- anaphylatoxins C3a和C5a-主要通过两个GPCR(C3aR和C5aR1)发挥其生理和病理功能。然而,这些受体的配体识别、活化和信号传导偏好性的分子机制仍不清楚。
来自美国南加州大学Cornelius Gati、印度理工学院Arun K. Shukla和Ramanuj Banerjee团队合作解析了由天然和合成激动剂激活C3aR和C5aR1的九种冷冻电镜结构,揭示了补体anaphylatoxins不同结合口袋的拓扑结构,为受体激活和信号转换提供了重要见解。研究人员还揭示了蛋白水解末端精氨酸抑制C5a炎症反应发生的结构基础,以及确定该情况下C3aR多肽激动剂诱发G蛋白信号传导具有偏好性。总之,本研究阐明了补体anaphylatoxins受体的内部工作机制,并可能促进结构导向的药物发现,从而在一系列疾病中靶向这些受体。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01074-7
2023/10/20
3.“De novo protein identification in mammalian sperm using in situ cryoelectron tomography and AlphaFold2 docking”
为了理解细胞通路的分子机制,当代的工作流程通常需要多种技术来识别蛋白质、追踪它们的定位以及在体外确定它们的结构。
来自美国加利福尼亚大学旧金山分校的David A. Agard,Ronald D. Vale以及Zhen Chen结合cryo-ET和AlphaFold2建模来解决这些问题,以了解哺乳动物精子是如何在原位构建的。本研究的细胞cryo-ET和亚细胞结构平均提供了轴丝微管结构的6.0埃重构密度。这些分辨率良好的三维结构使研究者能够无偏地将精子特定的密度与AlphaFold2预测的21,615个小鼠基因组蛋白质模型相匹配。他们确定了Tektin 5、CCDC105和SPACA9作为新的微管相关蛋白质。这些蛋白质形成了一个广泛的相互作用网络,交联轴丝双微管的腔室,暗示了它们在调节纤丝的机械特性中的作用。事实上,Tekt5 -/- 精子的鞭毛更加变形,出现了180°的弯曲。总之,本研究提出了一个细胞可视化蛋白质组学工作流程,并阐明了Tektin 5的体内功能。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01038-3
Nature
本周无
Science
本周无
2023.10.16~2023.10.22
子刊刊登文章
01
Molecular Cell
10.17
“Visualizing the chaperone-mediated folding trajectory of the G protein β5 β-propeller”
02
Nature Structural & Molecular Biology
10.16
1.“The substrate and inhibitor binding mechanism of polyspecific transporter OAT1 revealed by high-resolution cryo-EM”
10.19
2. “Structure of LRRK1 and mechanisms of autoinhibition and activation”
10.19
3.“Molecular mechanism of glutaminase activation through filamentation and the role of filaments in mitophagy protection”
03
Nature Communications
10.16
1.“Design, structure and plasma binding of ancestral β-CoV scaffold antigens”
10.16
2.“A single nanobody neutralizes multiple epochally evolving human noroviruses by modulating capsid plasticity”
10.16
3.“Distantly related Alteromonas bacteriophages share tail fibers exhibiting properties of transient chaperone caps”
10.17
4.“Streamlined structure determination by cryo-electron tomography and subtomogram averaging using TomoBEAR”
10.17
5.“An allosteric switch between the activation loop and a c-terminal palindromic phospho-motif controls c-Src function”
10.20
6.“Lactate dehydrogenase D is a general dehydrogenase for D-2-hydroxyacids and is associated with D-lactic acidosis”
10.20
7.“Structural basis for recruitment of TASL by SLC15A4 in human endolysosomal TLR signaling”
10.20
8. “A conformation-locking inhibitor of SLC15A4 with TASL proteostatic anti-inflammatory activity”
10.20
9.“Insights into the missing apiosylation step in flavonoid apiosides biosynthesis of Leguminosae plants”
10.20
10.“Structural insights into the agonists binding and receptor selectivity of human histamine H4 receptor”
Cell Research
本周无
Science Advances
本周无
作者 | 谭佳鑫
审稿 | 肖媛
责编 | 囡囡
设计、排版 | 可洲
微信号:FRCBS-THU
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